Introducción: En las últimas décadas se han desarrollado nuevas herramientas para disminuir el tiempo de diagnóstico de las infecciones por micobacterias.

Objetivos: Evaluar el sistema BacT ALERT 3D para aislamiento de micobacterias y compararlo con el cultivo en Löwenstein Jensen.

Materiales y Métodos: Se procesaron 1884 muestras recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis (IPK), de agosto 2010 - Diciembre 2013. Se inocularon en paralelo en Löwenstein Jensen (LJ) y BacT ALERT. Se compararon los resultados por ambos métodos y se calcularon los indicadores de desempeño.

Resultados: 1477 (78.3%) de las muestras correspondieron a pacientes VIH. La muestra más frecuente fue el esputo 1001 (53.1%), seguida de sangre 467 (24.8%), LCR 126 (6.7%) y biopsias 86 (4.6%). Por Bact/ Alert se identificaron 120 Mycobacterium tuberculosis (MTB) y 40 micobacterias ambientales; por LJ 96 MTB y 31 MA. El tiempo de detección de crecimiento (TDC) para MTB por BacT ALERT fue 16.2 días y 35 por LJ; para MA el TDC fue 15.9 días por Bact/ Alert y 34.7 días por LJ. La tasa de recuperación (TR) para MTB fue mayor por Bact/ Alert (97.6%). La concordancia de Bact Alert fue de 97.4% y la sensibilidad e índice de Youden fueron de 92 % y 0.9, respectivamente.

Conclusiones: El sistema Bact Alert permitió disminuir el tiempo de diagnóstico de las infecciones por micobacterias  y comenzar la terapéutica oportuna en los pacientes VIH+ con baciloscopía negativa. La combinación de cultivo líquido y sólido fue efectiva  para la recuperación del total de cepas.